PLoS One:全基因組測序罕見鼻腔癌
日期:2012-05-25 08:16:02
來自美國翻譯基因組研究院(TGen)和Scottsdale健康中心弗吉尼亞G. Piper癌癥中心的研究人員近期完成了對一種稱為嗅神經(jīng)母細胞瘤(ONB)的罕見鼻腔癌的全基因組測序。分析了構(gòu)成患者正常DNA和癌性DNA的數(shù)十億個分子發(fā)現(xiàn)了未來可作為先進的精準(zhǔn)施藥(precision medicine)藥物開發(fā)靶點的遺傳變異。研究結(jié)果在線發(fā)布在《PLoS One》雜志上。
“當(dāng)前對于晚期癌癥患者,尤其是罕見癌癥病例,醫(yī)生在制定治療計劃時只有少數(shù)幾個選擇,”文章的主要作者、弗吉尼亞G. Piper癌癥中心胸腔腫瘤科主任、TGen 癌癥和細胞生物學(xué)部臨床副教授Glen Weiss博士說。
“目前還沒有綜合的基因組測序研究鑒別這些罕見嗅神經(jīng)母細胞瘤的突變圖譜以確定這些患者的治療靶點,”Weiss博士說。
個體化醫(yī)療包括針對特異遺傳靶點的精確藥物以縮小、甚至消除腫瘤,而無常規(guī)化療的破壞性毒副作用。
參與研究的是一名在弗吉尼亞G. Piper癌癥中心接受數(shù)年標(biāo)準(zhǔn)護理治療包括手術(shù)、放療和常規(guī)化療的29歲年輕男子。他的轉(zhuǎn)移性嗅神經(jīng)母細胞瘤持續(xù)地突變并復(fù)發(fā),導(dǎo)致了畸變性損害和廣泛的手術(shù)進行整形重塑。
在Tgen研究人員對該名男子的活檢腫瘤和血液進行了分析,讀取了患者腫瘤DNA和正常DNA中數(shù)十億個分子堿基。比對鑒別出了幾個重要的基因突變,包括:MAP4K2, SIN3B, TAOK2, KDR, TP53, MYC和 NLRC4。這些基因是基于臨床關(guān)聯(lián)性和從前發(fā)布的關(guān)于靶基因和它們與癌發(fā)生相關(guān)性或癌癥產(chǎn)生及進化的文獻而選擇出來的。
論文的資深作者、TGen 綜合癌癥基因組學(xué)部主任及教授、研究副主任John Carpten說:“這些突變靶基因牽涉著DNA修復(fù)機制和凋亡的失常。這項研究提供了對這種罕見而可怕的癌癥類型基礎(chǔ)的新認(rèn)識。我們有希望能夠?qū)⑦@些研究結(jié)果轉(zhuǎn)化為改善罕見癌癥臨床治療的工具。”
文章還引證需要其他的研究來解析嗅神經(jīng)母細胞瘤癌癥突變和進展的機制,以及全基因組測序如何能夠在未來的分析中發(fā)揮重要的作用。
“隨著成本的降低、分析速度的提高和更全面地了解復(fù)雜的遺傳改變,我們預(yù)計全基因組測序?qū)谂R床更加頻繁地應(yīng)用到常見和罕見癌癥中,并為個體化醫(yī)療鋪平道路,”文章的另一位資深作者、Tgen神經(jīng)病基因組學(xué)部副主任和副教授David Craig博士說。
國家癌癥研究基金會會長Franklin C. Salisbury Jr. 說:“這項研究代表了癌癥研究的一個里程碑,通過基于基因組學(xué)的個體化醫(yī)療更好地治療甚至是治愈癌癥。全基因組測序讓科學(xué)家們對于許多癌癥的遺傳基礎(chǔ)獲得了更好的理解。基于測序揭示的突變,醫(yī)生將能夠鑒別出設(shè)計靶向這些突變的現(xiàn)有的抗癌藥物或是新抗癌藥物。這是一種治療性的研究。”
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