Nature發表蛋白質互作里程碑成果
日期:2015-09-08 08:56:14
德克薩斯大學和多倫多大學的科學家們日前繪制了超大規模的蛋白質互作圖譜。這項研究發表在九月七日的Nature雜志上,為研究阿爾茨海默癥、帕金森癥和癌癥等疾病的提供了強大的新工具。
細胞中的蛋白通常以蛋白復合體的形式,執行特異性的生物學功能。研究人員發現,海葵、線蟲、小鼠和人類共享近千種關鍵的蛋白復合體,這些蛋白復合體對動物的生存和發育非常重要。舉例來說,這些動物使用同樣的蛋白復合體,來確保頭部和眼部正確形成。
“我們可以在絕大多數動物的細胞中,繪制數千種不同蛋白的裝配圖,”德克薩斯大學的Edward Marcotte教授說。“人類蛋白復合體的裝配往往與其它物種沒什么兩樣。這類研究不僅能加深我們對共同進化祖先的認識,也有助于研究多種疾病的遺傳學基礎。”
研究人員選擇了有代表性的九個物種(包括線蟲、果蠅、小鼠、人類、海膽、???、青蛙、霉菌和酵母),對細胞中的蛋白進行了高通量質譜分析。隨后,他們將質譜分析的數據與已知的基因組信息相互對照。
“我們使這些動物中的已知蛋白互作增加到了原來的三倍,這是繪制蛋白互作網絡的一大進步,”多倫多大學的Andrew Emili教授說。
細胞內任何一個蛋白互作的缺失都有可能引發疾病,而蛋白互作圖譜可以幫助人們鑒定復雜疾病的根源。據介紹,這項研究中的數據將錄入開放獲取數據庫,對全世界的研究者們開放。
值得注意的是,這一圖譜已經在疾病研究中初露鋒芒,比如新發現的蛋白復合體Commander。Commander由十幾個蛋白組成,并且存在于所有動物細胞。研究人員發現,這些蛋白的編碼基因與人類智力障礙有關。于是他們在蝌蚪中破壞了Commander的蛋白組分,結果胚胎發育過程中的腦細胞定位發生了異常。這說明智力障礙可能與腦細胞定位異常有關。
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