Nature子刊發(fā)布癌癥外顯子組測序新成果
日期:2013-10-14 10:20:10
來自西班牙的研究人員確定了與膀胱癌相關的一些新遺傳信號通路和新基因;了解這些患者的遺傳標記是朝著認識這一疾病的生物學,改善患者治療邁出的第一步。這項研究發(fā)表在《自然遺傳學》(Nature Genetics)雜志上。
膀胱癌在許多的國家,尤其在西班牙是一種嚴重的公共健康問題。在西班牙每年記錄有11,200新增病例,是全球發(fā)病率最高的地區(qū)之一。大多數(shù)膀胱癌預后良好,確診后的五年生存率為70-80%,大約80%的病例確診時還沒有浸潤膀胱肌。
盡管如此,許多的腫瘤會出現(xiàn)復發(fā),需要定期鏡檢進行腫瘤監(jiān)測。這類后續(xù)追蹤觀察影響了患者的生活質量,同時也帶來了顯著的醫(yī)療費用。
西班牙國家癌癥研究中心(CNIO)上皮癌研究組負責人Francisco X. Real,以及遺傳與分子流行病學研究組負責人Nuria Malats,協(xié)調研究人員對非浸潤性膀胱癌進行了首次外顯子組測序。非浸潤性膀胱癌是最常見的膀胱癌類型,并且具有最高的復發(fā)風險。
研究結果揭示了一些與疾病相關的如細胞分裂和DNA修復等新遺傳信號通路,,以及新基因,這對于了解它的起源和進化有可能是至關重要的。
研究的主要作者、Real實驗室的博士后研究人員Cristina Balbás說:“我們對于膀胱癌的生物學所知甚少,這些信息對于分類患者、預測復發(fā)甚至是阻止疾病都將是有用的?!?SPAN lang=EN-US>
該研究對來自17名確診膀胱癌患者的外顯子組進行了分析,隨后通過在另外的60名患者中檢測一組特定基因驗證了這一數(shù)據(jù)。
“我們發(fā)現(xiàn)了9個此前未曾在這類腫瘤種描述過的變異基因,其中我們發(fā)現(xiàn)STAG2在大約40%的最小侵襲性腫瘤中失活,”Real說。
研究人員補充說:“其中一些基因與從前未曾在膀胱癌中描述過的、一些如細胞分裂和DNA修復遺傳信號通路有關;我們還證實并擴展了其他一些過去曾在這種癌癥類型中描述過的遺傳信號通路,如染色質重塑?!?SPAN lang=EN-US>
膀胱癌中的一個未知因子
“2年前STAG2基因被發(fā)現(xiàn)與癌癥相關,但對于它知之甚少,它與膀胱癌的關系我們也一無所知,”Balbás說。以往的研究表明在細胞分裂過程中它參與了染色體分離,這或許是它與癌癥相關之處,并且它還被證實與DNA的3D結構維持以及基因表達相關。
根據(jù)Real所說,與預計的相反,這篇論文揭示這一基因變異的腫瘤染色體數(shù)目往往不發(fā)生改變,這表明這一基因是通過染色體分離之外的不同機制參與了膀胱癌。
作者們還通過分析670多名患者的腫瘤樣本,發(fā)現(xiàn)STAG2變異與預后較好患者的腫瘤相關。






