Nature:解析核小體的重塑機制
日期:2013-05-27 09:13:34
在細胞核中,基因組DNA緊緊包裹在核小體上形成染色質(zhì),但基因在如此緊密的包裝中是無法表達的。現(xiàn)在德國慕尼黑大學LMU的研究團隊,揭示了局部釋放核小體DNA的分子機制,正是這一機制使染色體DNA得以轉錄。文章發(fā)表在本期的Nature雜志上。
高等生物的細胞核負責儲存基因組DNA,這些DNA環(huán)繞著由四種組蛋白組成的八聚體,形成碟狀的核小體結構。基因組DNA以這樣的形式包裝成為染色質(zhì),使DNA受到良好的保護。但在這種緊密包裝的狀態(tài)下,介導DNA轉錄、修復和復制的酶難以接觸到DNA,也就無法執(zhí)行其正常功能。
包括組蛋白分子伴侶在內(nèi)的核小體重塑因子,負責令染色質(zhì)保持動態(tài),以便進行DNA轉錄等程序。這些因子能夠局部修飾核小體結構,與組蛋白亞基相互作用,甚至能將緊密包裝的DNA從核小體上解開。
FACT復合體就是一種保守的組蛋白分子伴侶,是細胞分裂和DNA修復所必須的因子。FACT復合體能夠識別核小體,并在DNA轉錄、復制和修復過程中確保染色質(zhì)的完整性。FACT能特異性地與H2A-H2B組蛋白二聚體相互作用,這種二聚體是核小體標準結構的一部分。
FACT識別H2A–H2B二聚體的能力,是其多種功能的核心。“然而,至今我們還不了解這些組蛋白的識別機制,也不清楚FACT與H2A-H2B相互作用對其功能有何影響,”LMU的Andreas Ladurner教授說。“因此,我們需要了解FACT識別核小體時的結構基礎。”
Ladurner及其同事首先分析了FACT 復合體上與H2A-H2B結合的區(qū)域(Spt16M)。“這為我們提供了FACT與組蛋白相互作用的一些線索,但這樣的信息還不足以揭示核小體的識別機制,”文章的第一作者Maria Hondele說。“于是,我們又通過高分辨率的X射線晶體技術,分析了FACT與組蛋白二聚體結合時的結構。”
晶體結構顯示,FACT的結合阻斷了組蛋白二聚體上的一個關鍵位點,該位點與DNA的親和力很高。研究人員指出,Spt16M區(qū)域與組蛋白相互作用,使FACT逐漸侵入核小體,阻斷組蛋白二聚體與DNA的接觸。在此基礎上,FACT使部分核小體發(fā)生重塑,增強了“核小體呼吸”現(xiàn)象,使局部DNA從核小體上釋放出來,允許基因進行轉錄。“與傳統(tǒng)觀點不同的是,上述機制并不需要將DNA從核小體上完全解開,而是允許轉錄機器通過核小體,”Ladurner說。研究人員指出,正是借助上述機制,細胞核中的染色體裝配才得以實現(xiàn)動態(tài)調(diào)節(jié)。
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