來自約翰霍普金斯大學(xué)Kimmel癌癥中心的科學(xué)家們開發(fā)了一種測(cè)試方法，利用常規(guī)巴氏檢測(cè)（Pap test）獲得的宮頸分泌物來檢測(cè)卵巢癌及子宮內(nèi)膜癌。在一項(xiàng)初步研究中，研究人員采用這種命名為“PapGene”的測(cè)試方法，依靠全基因組測(cè)序癌癥特異性突變，檢測(cè)出了全部24個(gè)子宮內(nèi)膜癌，以及22個(gè)卵巢癌其中的9個(gè)，準(zhǔn)確率分別為100%和41%。這些實(shí)驗(yàn)結(jié)果發(fā)布在1月9日的《科學(xué)轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)》（Science Translational Medicine）雜志上。

盡管研究人員指出在臨床應(yīng)用前還需要開展較大規(guī)模的測(cè)試，他們也表示相信這種測(cè)試方法有潛力開創(chuàng)出新的全基因組癌癥篩查檢測(cè)。

巴氏測(cè)試是一種從子宮頸部獲取細(xì)胞，顯微鏡下檢測(cè)癌癥跡象的診斷方法，被廣泛及成功應(yīng)用于宮頸癌篩查。然而，當(dāng)前卻還沒有適用于卵巢癌和子宮內(nèi)膜癌的常規(guī)的篩查方法。

約翰霍普金斯大學(xué)腫瘤學(xué)副教授、Swim Across America實(shí)驗(yàn)室主任Luis Diaz博士說：“由于巴氏檢測(cè)偶爾包含有從卵巢或子宮內(nèi)膜脫落的細(xì)胞，來自這些器官的腫瘤細(xì)胞可能也存在于分泌液中。我們的基因組測(cè)序方法有潛力以一種可擴(kuò)展的、符合成本效益的方式檢測(cè)這些癌細(xì)胞。”

研究人員說，在婦科癌癥患者的宮頸液中，正常細(xì)胞的DNA與來自癌細(xì)胞的DNA混雜在一起。他們的任務(wù)是利用基因組測(cè)序?qū)┬?/SPAN>DNA與正常DNA區(qū)分開來。

為了區(qū)分測(cè)試中基因組區(qū)域的優(yōu)先次序，科學(xué)家們不得不先確定卵巢癌和子宮內(nèi)膜癌中最常見的遺傳改變。他們搜查了公開的全基因組卵巢癌研究，尋找卵巢癌特異性突變。由于無法獲得最常見子宮內(nèi)膜癌類型的全基因組研究，他們還對(duì)22個(gè)子宮內(nèi)膜癌展開了全基因組測(cè)序研究。

通過這些卵巢癌和子宮內(nèi)膜癌基因組數(shù)據(jù)，約翰霍普金斯大學(xué)研究小組在兩種癌癥中發(fā)現(xiàn)了12個(gè)最常見的突變基因，基于這些認(rèn)知開發(fā)出了PapGene測(cè)試。

隨后研究人員用PapGene檢測(cè)了來自卵巢癌和子宮內(nèi)膜癌患者的巴氏檢測(cè)樣本。新測(cè)試檢測(cè)出了早期及晚期階段的子宮內(nèi)膜癌和卵巢癌。對(duì)照組中沒有任何健康婦女被錯(cuò)誤歸類患有癌癥。

研究人員下一步打算用PapGene檢測(cè)更多地樣本，并致力提高檢測(cè)卵巢癌的靈敏度。“在月經(jīng)周期的不同時(shí)間進(jìn)行測(cè)試，將宮頸刷深插到宮頸管中，評(píng)估更多的基因組區(qū)域，采取這些措施或許能夠提高檢測(cè)的靈敏度，”約翰霍普金斯大學(xué)神經(jīng)外科助理教授Chetan Bettegowda博士說。

在美國(guó)，每年有近7萬婦女被確診卵巢癌和子宮內(nèi)膜癌，大約三分之一的婦女死于這些疾病。

“全基因組測(cè)試或可幫助早期檢測(cè)卵巢癌和子宮內(nèi)膜癌，使更多的人得到治愈，”研究生Yuxuan Wang說。新測(cè)試的費(fèi)用可能與當(dāng)前的宮頸液HPV測(cè)試相似，不會(huì)超過100美元。

研究人員表示，盡管PapGene是一種高靈敏度方法，可用于檢測(cè)癌癥特異性DNA突變，然而在擴(kuò)增、測(cè)序和分析等多個(gè)步驟過程中，有可能錯(cuò)誤生成假性突變。研究人員還需要為PapGene測(cè)序方法建立一種保障策略，以清除可能導(dǎo)致錯(cuò)誤測(cè)試結(jié)果的假象。

“如果不加解析，假象有可能會(huì)導(dǎo)致錯(cuò)誤的假陽性測(cè)試結(jié)果，錯(cuò)誤認(rèn)定健康人患癌，”研究生Isaac Kinde說。

Kinde開發(fā)了一種方法，在樣品制備的初期階段，在每個(gè)DNA片段上添加一種獨(dú)特的遺傳條碼。盡管在最終測(cè)序前每個(gè)DNA片段都會(huì)多次拷貝，通過他們的遺傳條碼可以追溯所有的新拷貝DNA至原始的DNA分子。如果來自同一DNA分子的拷貝并非都包含相同的突變，研究人員就會(huì)將之視作是一種假象，從而排除這一突變。而真正的突變，在最初加條碼之前就會(huì)存在于樣本中，因此也將存在于原始DNA分子及其所有來源于它的拷貝中。