Cell頭條:奇妙的基因組“手風琴”
日期:2012-08-21 08:24:00
單個基因的復制就能對抗宿主抗病毒防御,這聽起來好像不太真實,但是痘病毒(poxviruses)在病毒演化過程中,通過一個基因的快速多拷貝擴增,就能適應并對抗宿主的抗病毒防御,這被稱為“基因組手風琴”(Genomic Accordions),利用這個機制,痘病毒實現了突變率雖然低,但能快速進化,這一由Fred Hutchinson癌癥研究中心完成的成果公布在Cell雜志上。
同期Cell也以“Poxvirus Use a Gene Accordion to Tune Out Host Defenses”為題推薦了這項研究成果,專家們指出,“基因擴增,突變和刪除的多步驟過程,幫助痘病毒克服了宿主的抗病毒防御,這種機制能遺傳適應性,將能在許多生物學事件進行廣泛的應用。”
痘病毒(Poxviridae)是哺乳動物的最大及最復雜的病毒,包含兩個亞科痘病毒脊索亞科 (Chordopoxvirinae)、痘病毒昆蟲亞科 (Entomopoxvirinae),其中最有名的就是天花病毒,天花的病原Variola病毒為Orthopoxvirus屬,這一病毒曾經摧殘全人類,目前已被撲滅,但是最近常被認為是一種有可能之再新興之疾病。其它的痘病毒如駱駝痘(camel pox)及ectromelia造成低等動物的皮膚發疹。
痘病毒屬于雙鏈DNA病毒,與RNA病毒不同,雙鏈DNA病毒雖然突變率低,但是卻能快速進化,從而發展出對人類和動物攻擊性強的病毒變種。那么痘病毒是采用了什么機制,實現這一進化的呢?
在這篇文章中,研究人員揭開了這個謎底,他們指出了這種大型的雙鏈DNA是通過一種特殊機制,從而能從宿主的免疫系統中逃脫出來,并變得具有耐藥性的,這種機制不僅有助于理解傳染疾病在動物和人類傳播的機制,而且也可以用于分析其它生物學現象。
文章的通訊作者為Fred Hutchinson癌癥研究中心的Harmit S. Malik,以及Nels C. Elde,或者表示,“痘病毒中有許多編碼基因,能幫助它們對抗宿主免疫防御,促進傳染”,“盡管有充足的證據表明,痘病毒基因組發生了適應性變化,克服了宿主防御,但是我們仍然不知道這一機制的具體內容。”
為了弄清楚這一機制,研究人員細胞培養了牛痘病毒,這是之前用在天花疫苗中的一種病毒,研究人員希望通過分析這種病毒的變化,來模擬病毒適應性進化。
之前的研究證明一種宿主防御蛋白:PKR(蛋白激酶R)是痘病毒傳染的主要屏障,為此痘病毒通過進化出兩個編碼基因:K3L和E3L,來對抗這一屏障。研究人員分析了牛痘病毒在敲除E3L基因后如何演化,從而在有人類PKR存在的前提下成功復制。
“戲劇性的是,這個‘弱化’后病毒的快速系列變化,導致其病毒株在人類細胞中能快速的復制”,Malik說。研究人員進一步分析了這種演化模式,發現病毒快速擊敗PKR,是通過選擇性的增加了基因組中K3L基因的拷貝數。
Malik將這種快速適應比喻成樂器手風琴的風箱在拉動的時候出現的膨脹,“當K3L拷貝數持續增多,K3L蛋白的表達也快速擴張,從而抑制了免疫系統的應答”,他說。這表明能快速擴充其基因組的病毒,具有比其它未能擴充的病毒,更具即時進化能力。
而且這一手風琴的比喻也有進一步的含義——除了觀察到E3L缺失病毒株的快速基因表達,研究人員還發現在獲得了一個適應性突變后,病毒又交換了一個有益的突變,形成更小的基因組印跡。
“我們的研究表明盡管痘病毒基因表達并不長,但是能進行有效適應性進化,這有助于它們在免疫系統,和藥理環境中存活下來”,Malik說,“找到這種擴增的方式,也許能為我們提供對抗相關病原體更有效的抗病毒策略?!?/SPAN>
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