Nature頭條:這是一個(gè)神奇的網(wǎng)絡(luò)
日期:2012-06-26 08:16:24
在大科學(xué)項(xiàng)目清單中重點(diǎn)強(qiáng)調(diào)的一個(gè)項(xiàng)目,就是找到人類(lèi)大腦的“布線(xiàn)圖”,這個(gè)包含有上千億個(gè)神經(jīng)細(xì)胞,百萬(wàn)億個(gè)神經(jīng)連接的大型網(wǎng)絡(luò),調(diào)控著我們機(jī)體的各種動(dòng)作,各個(gè)決策,以及喜怒哀樂(lè)。要了解這個(gè)神奇的大腦網(wǎng)絡(luò),第一步,我們需要完成完整小鼠大腦的圖譜。
來(lái)自冷泉港實(shí)驗(yàn)室的研究人員完成并公布了小鼠大腦環(huán)路的詳細(xì)細(xì)節(jié),這第一批數(shù)據(jù)包含有500 terabytes,這個(gè)稱(chēng)為小鼠大腦結(jié)構(gòu)工程(Mouse Brain Architecture Project,MBA)的項(xiàng)目計(jì)劃描述嚙齒類(lèi)動(dòng)物大腦整個(gè)分布情況,這是首個(gè)脊椎動(dòng)物大腦環(huán)路圖譜。
“目前關(guān)于大腦環(huán)路的信息并不完整”,美國(guó)國(guó)家藥物濫用研究所遺傳學(xué)與分子神經(jīng)生物學(xué)專(zhuān)家Jonathan Pollock 說(shuō),“缺乏神經(jīng)環(huán)路的信息,使得科學(xué)團(tuán)隊(duì)認(rèn)識(shí)到需要構(gòu)建關(guān)于大腦微觀(guān),中觀(guān)和宏觀(guān)尺度的圖譜。”
MBA項(xiàng)目填補(bǔ)一些研究的空白,比如美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院的人類(lèi)連接組項(xiàng)目(Human Connectome Project),以及ALLEN Brain Connectivity Atlas。前者計(jì)劃在人類(lèi)大腦功能的基礎(chǔ),分享有關(guān)人類(lèi)大腦的結(jié)構(gòu)和功能連接的數(shù)據(jù)映射神經(jīng)通路,這一項(xiàng)目將使我們理解是什么使我們?nèi)祟?lèi)能創(chuàng)造出重大進(jìn)展,并會(huì)為未來(lái)在許多神經(jīng)和精神疾病的異常腦回路研究建立一個(gè)新階段。
而后者則是由Paul G. Allen和Jody Allen Patton共同投資興建的非盈利性質(zhì)的醫(yī)療機(jī)構(gòu)——腦科學(xué)Allen研究院進(jìn)行的關(guān)于大腦連接的一項(xiàng)整體分析。
Pollock教授表示,由于小鼠一直以來(lái)都是人類(lèi)遺傳學(xué)的一個(gè)重要模型,對(duì)于我們了解在一些疾病,比如阿爾茲海默,自閉癥,神經(jīng)分裂等方面提供了許多幫助。近年來(lái)科學(xué)家們聚焦于哺乳動(dòng)物大腦,通過(guò)電子顯微等技術(shù),分析個(gè)體突觸,神經(jīng)元之間連接點(diǎn)等。但是這些方法對(duì)于分析整個(gè)小鼠大腦來(lái)說(shuō),并不實(shí)用。
冷泉港實(shí)驗(yàn)室的研究人員采用4個(gè)注入示蹤劑來(lái)追蹤大腦環(huán)路,其中兩個(gè)是“經(jīng)典”的示蹤劑——霍亂毒素亞單位(choleratoxin subunit B),以及雙向神經(jīng)示蹤劑(biotinylated dextran amines),還有兩個(gè)是病毒示蹤劑:腺病毒群(adeno-associated virus),和經(jīng)修改的狂犬病毒。
這項(xiàng)研究獲得了小鼠大腦切片的高清晰度圖像,每張圖像大約都有十億像素。每個(gè)大腦大約有500張圖片,每張圖片拍攝的是20微米厚度的大腦組織光學(xué)成像結(jié)果。
除此之外,研究人員還在其中添加了公開(kāi)的一些數(shù)據(jù),神經(jīng)科學(xué)家能通過(guò)http://mouse.brainarchitecture.org 獲取所有信息。這一網(wǎng)站采用的是“虛擬顯微”,來(lái)觀(guān)察大腦內(nèi)部,可以放大,顯示個(gè)體神經(jīng)元,以及神經(jīng)過(guò)程。研究人員可以采用不同的分辨率顯示器查看圖像。
領(lǐng)導(dǎo)這一項(xiàng)目的生物物理學(xué)家Partha Mitra表示,將與大家共享這些數(shù)據(jù),除此之外,其研究組還準(zhǔn)備了一個(gè)教程,幫助一些不是這一領(lǐng)域的研究人員利用這一網(wǎng)站的資源。
在大腦作圖方面,2010年中國(guó)的科學(xué)家也獲得了突出的成果:研制了顯微光學(xué)切片層析成像系統(tǒng),從而能獲得了小鼠全腦高分辨率圖譜。這一研究成果公布在Science雜志上。
研究人員利用顯微光學(xué)切片層析成像系統(tǒng),對(duì)制備好的鼠腦為樣本,全自動(dòng)連續(xù)242小時(shí)進(jìn)行了數(shù)據(jù)采集,共獲得15380層像素分辨率為0.3×0.3微米的冠狀斷面圖像。同時(shí),科研組利用高定位精度的三維移動(dòng)平臺(tái),及在切片中采用對(duì)先采取到的信息進(jìn)行驗(yàn)證分析的方法,對(duì)圖像準(zhǔn)確定位和預(yù)處理,實(shí)現(xiàn)了突起水平的小鼠全腦結(jié)構(gòu)成像,獲得了一套來(lái)自同一只老鼠的全腦組織切片圖譜。這種介觀(guān)水平的小鼠全腦神經(jīng)解剖圖譜,為數(shù)字化鼠腦結(jié)構(gòu)和腦功能仿真研究提供了重要的基礎(chǔ)性實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)參考。






