科學家們?yōu)榱四苌钊肓私馓禺愋曰虮磉_，發(fā)展了許多實驗技術，比如芯片技術，PCR，高通量測序等，但是要想得到精確的結果，仍然依賴于實驗操作人員對于技術掌握的熟練程度。而且隨著基因表達研究越來越多，為了確保公布的結果的精確性，對于相關分析也越來越嚴格。不過所幸目前也有了更多基因表達分析相關的產品，這些產品帶來的新技術也許能幫助我們解決難題。

非編碼RNA分析

近年來非編碼RNAs，microRNAs成為了研究熱點，不少研究成果表明miRNAs在基因表達分析中扮演了重要角色，這些小分子片段經過蛋白行使功能，它們直接與mRNA相互作用，抑制翻譯。現(xiàn)代生命科學表明，僅通過分析轉錄，基因表達，并不能告訴我們所有的事情。

著名的Life Technologies公司今年推出了一款新型的microRNA分析平臺：TaqMan OpenArray MicroRNA Panels，這一平臺能對每一樣本檢測數(shù)百種microRNA，分析樣品覆蓋700多個條人類和嚙齒類動物（小鼠和大鼠），而且這一分析平臺需要的樣品少——只需低至100毫微克的總RNA，分析速度快——8小時工作日內可以處理36個樣本（33nl的反應體系，每個Panel可以處理3個樣本），因此是一種適合中高通量microRNA研究的選擇。

除此之外，上文提及的nCounter miRNA表達系統(tǒng)也可以用于非編碼RNA的分析，這一系統(tǒng)包括人類，小鼠和大鼠的miRNAs分析平臺，可以在同一試管中定量分析mRNAs和miRNAs。

基因表達數(shù)據處理

基因表達實驗分析中產生的數(shù)據越來越多，要分析這龐大的數(shù)據群無疑是一個挑戰(zhàn)，而且除了數(shù)據數(shù)量以外，從中整理出相關數(shù)據也令人頭疼，比如研究人員也許希望同時分析幾個相關因素數(shù)據，或者排除地點，和時間的影響來分析樣品數(shù)據，而且研究人員還常常需要分析不同平臺獲得基因表達數(shù)據之間的相關性。

來自全球最大的統(tǒng)計學軟件公司推出的JMP Genomics軟件是JMP家族的一員，JMP統(tǒng)計軟件能幫助研究人員將生命科學數(shù)據完全可視化，促進高效、互動的數(shù)據探索和分析。這一軟件系統(tǒng)可以應用到從實驗室工作臺到病床的全過程中，優(yōu)化研究和開發(fā)周期，還可以分析藥物從臨床前到后期市場營銷的的整個生命周期表現(xiàn)。

JMP Genomics應用廣泛，可以連續(xù)分析伴隨有海量數(shù)據的芯片實驗，以及高通量測序研究中產生的數(shù)據組，SAS的JMP生命科學產品部經理Shannon Conners表示SAS將這些分析工具歸于特殊數(shù)據類型，“比如像是RNA測序分析之類的數(shù)據分析，都有簡化的流程”，新出品的JMP Genomics5.1將帶來更多的方便。

另外作為測序領域的領先科技公司，Illumina也有針對基因表達分析的相關軟件，其GenomeStudio數(shù)據分析軟件可以用來查看和分析基因表達產生的數(shù)據，GenomeStudio軟件中性能優(yōu)化的工具和用戶友好的圖形化界面讓研究人員能夠快速輕松地將數(shù)據轉化成有意義的結果。

這些分析工具顯示了基因表達分析與其它方法結合的進步，這些技術的結合將有助于基因表達分析越來越快，也越來越簡單。