Nature:向著癌癥相關(guān)mRNA開炮
日期:2016-07-28 09:12:59
大多數(shù)癌癥藥物都被設(shè)計來阻止細(xì)胞生長,這是癌癥的一個標(biāo)志,控制細(xì)胞生成成千上萬種蛋白質(zhì)的信號通路是一個受歡迎的靶標(biāo)。
來自加州大學(xué)伯克利分校的研究人員現(xiàn)在發(fā)現(xiàn)了這一信號通路中一個有前景的新藥物靶標(biāo),其之所以具有吸引力,部分原因在于它似乎控制了機(jī)體一小部分蛋白質(zhì)的生成,而這些蛋白對于調(diào)控生長和細(xì)胞增殖至關(guān)重要。
這一靶標(biāo)是一種結(jié)合信使RNA的蛋白質(zhì),它幫助啟動了蛋白質(zhì)合成,沿著生產(chǎn)線最終生成了一種完全組裝的蛋白。采用一種藥物阻斷這一結(jié)合蛋白可以關(guān)閉促生長蛋白翻譯,而不影響細(xì)胞內(nèi)其他對生命至關(guān)重要的蛋白質(zhì)。這項研究發(fā)布在7月27日的《自然》(Nature)雜志上。
該研究的領(lǐng)導(dǎo)者、加州大學(xué)伯克利分校分子與細(xì)胞生物學(xué)、化學(xué)教授Jamie Cate說:“如果癌細(xì)胞正在生成過多的mRNA,你可以通過阻止癌細(xì)胞利用這一mRNA來生成蛋白質(zhì)由此讓它們停工。由于常規(guī)的翻譯不會利用這一結(jié)合蛋白——并不是每個mRNA都利用該蛋白,你或許能夠通過靶向它來獲得更特異的抗癌效應(yīng)。”
這一研究發(fā)現(xiàn)令人感到驚喜,因為這一蛋白是一個更大的蛋白質(zhì)組裝體:真核起始因子3(eIF3)的組成部分。Cate說,人們知道eIF3并對其開展了近50年的研究,沒有人懷疑過它在細(xì)胞中發(fā)揮了秘密的作用。這或許是因為只有當(dāng)eIF3結(jié)合一組特異的mRNAs,其選擇性控制mRNA翻譯的能力才會被開啟。eIF3與這些mRNAs結(jié)合打開了eIF3中的一個口袋,隨后附著在mRNA的端帽上,觸發(fā)了翻譯過程。
Cate說:“對于我來說,就像發(fā)現(xiàn)了打開舊書桌中隱藏抽屜的一個秘密杠桿。這一書桌存在了大約15億年,數(shù)十年來許多人一直在研究它,而我們發(fā)現(xiàn)了如何觸動這一通路。”
Lee和Cate的研究暗示,這一神秘的杠桿(其只觸發(fā)了一部分特異的mRNAs的翻譯——有可能是細(xì)胞生成的約10,000種mRNAs中的500種)將被發(fā)現(xiàn)在癌癥以外的其他疾病,以及在植物和動物中均發(fā)揮至關(guān)重要的作用。
論文的第一作者、加州大學(xué)伯克利分校癌癥協(xié)會前博士后研究人員Amy Lee說:“查看其他的生物,如作物和致病真菌,弄清楚這一蛋白調(diào)控了哪些mRNAs將會是件令人興奮的事情。沿著這條路走下去,你可以想象找到一些方法來操控在這些不同的系統(tǒng)中mRNAs結(jié)合eIF3的方式。”
藏而不露
失控性細(xì)胞生長是癌癥的特點,這意味著蛋白質(zhì)生產(chǎn)機(jī)器要高速運轉(zhuǎn)來為新細(xì)胞提供建筑材料和控制系統(tǒng)。因此,數(shù)十年來生物學(xué)家們一直在研究控制了基因如何轉(zhuǎn)錄為mRNA,以及如何讀取和將mRNA翻譯為功能性蛋白質(zhì)的蛋白。
40多年前提出的一個重要觀點認(rèn)為,所謂的起始蛋白必須結(jié)合每個mRNA末端的一個化學(xué)把手,通過蛋白質(zhì)制造工廠——核糖體開始啟動翻譯。直到現(xiàn)在,eIF4E都被認(rèn)為是所有的mRNA的起始蛋白。
Cate說:“當(dāng)細(xì)胞無法控制如何利用這一化學(xué)把手時,細(xì)胞會失去控制并致癌。直到現(xiàn)在,人們一直認(rèn)為應(yīng)歸因于結(jié)合這一把手的eIF4E。”
早些時候,Cate和Lee發(fā)現(xiàn)某一部分特異的mRNAs(大多數(shù)與癌癥有關(guān)聯(lián)),是由eIF3中一種不同的蛋白質(zhì)觸發(fā)了翻譯起始(Nature重要發(fā)現(xiàn):抗癌向著mRNA開炮 )。此前,人們認(rèn)為這一蛋白只是mRNA翻譯必需的大約十幾個通用起始因子之一。
然而,他們發(fā)現(xiàn)13個獨立蛋白的組裝體eIF3,結(jié)合了只存在于這一部分特異mRNAs上的一個獨特標(biāo)簽。
“我們發(fā)現(xiàn)40多年來藏而不露的另一個蛋白,也結(jié)合了mRNAs末端的化學(xué)把手促進(jìn)了翻譯。它是eIF3的一個組件,一種叫做eIF3d的蛋白,此前從未將它與結(jié)合這一化學(xué)把手聯(lián)系到一起。”
隨后對eIF3d采用X-射線晶體學(xué)揭示出,當(dāng)eIF3結(jié)合這一mRNA標(biāo)簽時必須發(fā)生結(jié)構(gòu)重排,由此打開了這一秘密隔室。研究人員計劃利用冷凍電鏡開展進(jìn)一步的研究定位開啟這一隔室的真正觸發(fā)器。
Cate說:“從根本上說,我們發(fā)現(xiàn)了打開這一神秘之門的按鈕,但我們真的不知道這一按鈕看起來像什么。”
2013年,Whitehead研究所的研究人員證實,蛋白質(zhì)的生成與癌細(xì)胞賴以生存和增殖的一個高度保守的應(yīng)激反應(yīng)緊密相關(guān)。在小鼠癌癥模型中,靶向性治療抑制蛋白翻譯可以破壞這一生存反應(yīng),大大減慢腫瘤生長速度,并有可能使得耐藥性腫瘤對其他療法恢復(fù)敏感。他們的研究工作發(fā)表在Science雜志上。
2013年,來自中科院計算技術(shù)研究所生物信息學(xué)研究組,生物物理研究所等處的研究人員通過建立一個綜合性的數(shù)據(jù)分析流程,比較了poly(A)+及 poly(A)mRNA 在正常細(xì)胞系和對應(yīng)的癌癥細(xì)胞系中的表達(dá)差異,指出poly(A)mRNA 也可能在癌癥的發(fā)生和發(fā)展中發(fā)揮著重要的作用。






