由麻省大學(xué)醫(yī)學(xué)院Katherine A. Fitzgerald領(lǐng)導(dǎo)的研究小組證實(shí)，一種長(zhǎng)鏈非編碼RNA lincRNA-EPS發(fā)揮轉(zhuǎn)錄剎車作用限制了炎癥。這一重要的研究發(fā)現(xiàn)發(fā)布在6月16日的《細(xì)胞》（Cell）雜志上。

細(xì)胞類型特異性的調(diào)控回路以復(fù)雜、動(dòng)態(tài)和短暫調(diào)節(jié)的方式控制著基因表達(dá)。了解這些調(diào)控網(wǎng)絡(luò)對(duì)于更好地認(rèn)識(shí)促成人類健康和疾病的生物學(xué)過(guò)程至關(guān)重要。天然免疫系統(tǒng)是機(jī)體對(duì)抗微生物感染的第一道防線，依賴于種系編碼的模式識(shí)別受體檢測(cè)到微生物產(chǎn)物時(shí)發(fā)起的動(dòng)態(tài)轉(zhuǎn)錄改變。這些受體觸發(fā)信號(hào)級(jí)聯(lián)反應(yīng)通過(guò)一些轉(zhuǎn)錄因子包括NF-κ和干擾素調(diào)控因子（例如IRF3)，誘導(dǎo)成百上千的免疫反應(yīng)基因(IRGs)轉(zhuǎn)錄。由于IRGs持續(xù)表達(dá)可導(dǎo)致組織損傷和免疫病狀，它們的表達(dá)必須受到精細(xì)調(diào)控。轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)錄后調(diào)控檢查點(diǎn)確保了這些事件的幅度和持續(xù)時(shí)間受到嚴(yán)格控制，并及時(shí)關(guān)閉這些信號(hào)通路。

人類和小鼠基因組的大部分都被轉(zhuǎn)錄為非編碼RNAs(ncRNAs)。在這些ncRNAs，眾所周知microRNAs是基因表達(dá)的調(diào)控因子。此外，長(zhǎng)鏈非編碼RNAs(lncRNAs)也在各種生物背景中調(diào)控了表達(dá)。為了將它們與非編碼小RNA分子區(qū)分開(kāi)，lncRNAs定義為是長(zhǎng)度≥200個(gè)核苷酸的RNA。通過(guò)結(jié)合染色質(zhì)修飾因子、核不均一核糖核蛋白(hnRNPs)或轉(zhuǎn)錄因子，lncRNAs控制了基因轉(zhuǎn)錄。此外，lncRNAs還可通過(guò)靶向mRNAs剪接、穩(wěn)定性或翻譯的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控機(jī)制發(fā)揮作用。盡管已在幾乎所有的免疫細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)了lncRNAs，但它們?cè)谶@些細(xì)胞中的功能很大程度上仍有待探索。

2013年，Sanford-Burnham醫(yī)學(xué)研究所的科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)，在病原體入侵使特定白細(xì)胞（巨噬細(xì)胞）激活時(shí)，生成了新的復(fù)合體。研究顯示，上述復(fù)合體參與了對(duì)TNF-alpha的遺傳學(xué)控制，而TNF-alpha是能促進(jìn)炎癥的強(qiáng)力細(xì)胞因子。研究人員將形成復(fù)合體的lincRNA命名為THRIL。文章指出，THRIL不僅與川崎病有關(guān)，可能還涉及了其它的炎癥，例如類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎和炎癥性腸病等。這項(xiàng)成果發(fā)表在PNAS雜志上。

2014年，來(lái)自中科院、福建農(nóng)林大學(xué)等機(jī)構(gòu)的研究人員在新研究中證實(shí)，一種叫做NRAV的長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)通過(guò)抑制干擾素刺激基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控了抗病毒反應(yīng)。這一研究發(fā)現(xiàn)發(fā)表在11月12日的《Cell, Host & Microbe》雜志上。

2015年，在紐約大學(xué)Langone醫(yī)學(xué)中心病理學(xué)系分子免疫學(xué)教授Dan Littman的領(lǐng)導(dǎo)下，研究人員發(fā)現(xiàn)了一種特殊的酶DDX5必須首先展開(kāi)一個(gè)叫做Rmrp的遺傳物質(zhì)小片段來(lái)激活輔助性T細(xì)胞17(Th17)細(xì)胞。論文發(fā)布在Nature雜志上。

在這篇Cell文章中，研究人員發(fā)現(xiàn)了一個(gè)免疫調(diào)控lincRNA—— lincRNA-EPS，在巨噬細(xì)胞中其受到精確調(diào)控控制了IRGs的表達(dá)。分析來(lái)自lincRNA-EPS缺陷小鼠巨噬細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組，結(jié)合功能獲得和解救實(shí)驗(yàn)揭示出了這一lincRNA在抑制IRG表達(dá)中的特殊作用。與之相一致，lincRNA-EPS缺陷小鼠顯示在遭到內(nèi)毒素攻擊后炎癥增強(qiáng)及喪命。lincRNA-EPS定位在IRGs的調(diào)控區(qū)域，控制了核小體定位并抑制了轉(zhuǎn)錄。此外，他們證實(shí)lincRNA-EPS是通過(guò)3′端的一個(gè)CANACA模體與核不均一核糖核蛋白L互作介導(dǎo)這些效應(yīng)的。

這些研究結(jié)果確定了lincRNA-EPS是炎癥反應(yīng)的一個(gè)抑制因子，并突顯了lincRNAs在免疫系統(tǒng)的重要性。