Nature子刊:利用納米孔檢測多個抗體
日期:2016-04-12 08:51:10
英國劍橋大學的研究人員近日在《Nature Nanotechnology》上發文稱,他們可利用石英納米孔來識別啞鈴狀的DNA結構,從而實現抗體檢測。
Nicholas Bell和Ulrich Keyser利用DNA折紙(DNA origami)的原理來設計出一種結構,它攜帶了獨特的數字條形碼,由多個啞鈴狀的DNA發夾結構組成。利用納米孔,他們能夠以94%的準確性讀取三位的條形碼。之后,他們在DNA鏈中摻入抗原,每次最多可檢測四個抗體。
在這項研究中,研究人員利用DNA載體來選擇性驅動蛋白質通過納米孔。Keyser負責控制納米孔的大小。他們創建了雙鏈DNA結構,其中一條鏈帶有啞鈴狀的發夾結構。
首先,研究人員需要建立單個數字位,可被納米孔讀取。為了與背景信號區分開,他們發現需要在雙鏈DNA骨架上摻入多個發夾結構。發夾結構越少,每條DNA鏈中的位數就越多,而發夾結構越多,可帶來更強的信號和更高的準確性。在編碼更多數據和獲取更強信號之間,研究人員權衡再三,選擇了每位有11個發夾結構。
然后,他們構建了三位的數字系統,形成八個獨特的條形碼。之后,他們將這些條形碼融入呈遞抗原的DNA載體分子,用它來結合抗體。“抗體的存在不會顯著影響DNA的動力學,”作者寫道,這意味著利用條形碼可讀取抗體的存在。
為了證明這一點,Bell和Keyser創建出呈遞生物素、BrdU、嘌呤霉素和地高辛的結構,并成功檢測了濃度低至10納摩爾的抗體。他們認為,這種技術有望應用于科研和臨床診斷。
納米孔測序儀以往常用于DNA的檢測,不過在蛋白檢測方面,最近也有不少新進展。早前,賓夕法尼亞大學的一個研究小組對納米孔的開口進行了改造,以容納較大的蛋白。通過這種方式,他們區分了GCN4-p1蛋白的單體和二聚體結構。
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