Genome Res:借助CRISPR技術(shù)構(gòu)建首個人類完全單倍體細(xì)胞系
日期:2014-11-18 08:46:13
來自奧地利的一個科學(xué)家小組構(gòu)建出了第一個人類完全的單倍體細(xì)胞系——每個細(xì)胞均只包含23條染色體的單個副本。為了生成這些細(xì)胞,研究人員借助了稱作為CRISPR/Cas9的基因編輯技術(shù)。他們的研究結(jié)果發(fā)布在11月4日的《基因組研究》(Genome Research)雜志上。
由于缺少第二基因拷貝大大簡化了基因失活,人類近單倍體細(xì)胞系成為了遺傳篩查和基因組工程的重要工具。然而,一直以來缺乏人類完全單倍體細(xì)胞系,阻礙了對某些基因的遺傳操控。除15號染色體的一個30兆堿基(megabase)的雜合片段外,人類近單倍體細(xì)胞系HAP1包含了所有染色體的單個副本。這一大的片段具有330個基因,被整合到了19號染色體的長臂上。
任職于維也納的一家生物技術(shù)公司Haplogen Genomics的Tilmann Burckstummer說:“盡管我們的手邊擁有了這種近單倍體細(xì)胞系,但它包含的這一15號染色體大片段讓我們感到非常困擾。這一片段達(dá)到了最小染色體的一半大小,因此是一個相當(dāng)大的DNA片段。”
Burckstummer和同事們希望能夠除去這一添加在19號染色體中的DNA大片段,使得檢測15號染色體上的基因功能變得更加的容易。“利用二倍體細(xì)胞開展研究,如果你在一個拷貝的基因中導(dǎo)入突變,它的效應(yīng)可以被另一個拷貝所掩蓋,”Burckstummer說。
為了除去這一跨越330個基因,近3000萬個堿基對的遺傳物質(zhì),研究人員轉(zhuǎn)而借助了CRISPR/Cas9技術(shù)。他們設(shè)計(jì)出了一些引物,使得Cas9內(nèi)切核酸酶靶向這一多余片段的任一末端,隨后篩查了生成的細(xì)胞系——大約400個不同的克隆,找到了正確刪除這一片段的細(xì)胞系。兩個克隆符合期望的最終產(chǎn)物:生成了沒有額外的15號染色體部分的完全單倍體細(xì)胞系。
Burckstummer說:對于那些試圖闡明基因突變對于人類細(xì)胞影響的遺傳學(xué)家們來說,這些單倍體細(xì)胞將很有用處。但這并不只是這篇新論文的唯一收獲,它還提供了第一個例子將CRISPR/Cas9系統(tǒng)用于這樣大的DNA片段。它能夠起作用(即便只是在1%的細(xì)胞中),這一事實(shí)也意味著科學(xué)家們有可能能夠利用CRISPR/Cas9來重排或是刪除其他的DNA大片段。
“還沒有很多的論文顯示以這樣的效率來缺失大片段。令人欣慰的是,這些細(xì)胞各處均未發(fā)生突變。”盡管一些關(guān)于CRISPR/Cas9的初期研究發(fā)現(xiàn)了這一系統(tǒng)的許多脫靶效應(yīng),近期的一些論文中卻較少發(fā)現(xiàn)這些有害的突變。






